SecureDoc Disk Encryption w sposób transparentny szyfruje całą powierzchnię dysku oferując maksymalny, możliwy do osiągnięcia poziom bezpieczeństwa.
Program szyfrując dysk lub partycję szyfruje każdy jego sektor, dzięki czemu wszystkie informacje przechowywane są na nim wyłącznie w formie zaszyfrowanej, łącznie z samym systemem operacyjnym, wszystkimi danymi, plikami tymczasowymi, plikiem wymiany (swap file), plikami znajdującymi się w koszu na śmieci oraz plikami usuniętymi z kosza. Gwarantuje to, że żadne poufne informacje nigdy nie znajdą się choćby tymczasowo w niezaszyfrowanej formie na dysku, a tym samym nie będą mogły być przechwycone przez osoby niepowołane.